Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndufs3Q9DCT2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms