Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms