Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3fQ9DCH4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms