Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgn3Q9DCB1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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