Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC61

Pmpca, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcaQ9DC61 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcaQ9DC61 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcaQ9DC61 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms