Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc46a3Q9DC26 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc46a3Q9DC26 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms