Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syde1Q9DBZ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syde1Q9DBZ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms