Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf6Q9DBU5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms