Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Riok3Q9DBU3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Riok3Q9DBU3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms