Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc97Q9DBT3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms