Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms