Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Med27Q9DB40 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Med27Q9DB40 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms