Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim23Q9DAL0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms