Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgf29Q9DA08 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgf29Q9DA08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms