Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp12Q9D9M2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp12Q9D9M2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp12Q9D9M2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp12Q9D9M2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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