Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt1Q9D9J3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms