Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntd1Q9D995 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms