Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hm13Q9D8V0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms