Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms