Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Derl3Q9D8K3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms