Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Alkbh4Q9D8F1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms