Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn9Q9D805 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Capn9Q9D805 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms