Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmigd1Q9D7L8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmigd1Q9D7L8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms