Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
2310002L09RikQ9D7L5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms