Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms