Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chmp4cQ9D7F7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms