Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc3Q9D6Y1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc3Q9D6Y1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms