Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra4Q9D6F4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabra4Q9D6F4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms