Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PudpQ9D5U5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PudpQ9D5U5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms