Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf6Q9D4J7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Phf6Q9D4J7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms