Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sohlh2Q9D489 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms