Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Fndc8Q9D2H8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms