Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc6bQ9D289 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Trappc6bQ9D289 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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