Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Spns3Q9D232 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Spns3Q9D232 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Spns3Q9D232 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spns3Q9D232 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spns3Q9D232 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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