Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chordc1Q9D1P4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms