Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D1K7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D1K7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms