Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl53Q9D1H8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms