Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms