Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc47Q9D024 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc47Q9D024 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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