Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Shisa9Q9CZN4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Shisa9Q9CZN4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms