Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nde1Q9CZA6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms