Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssbp2Q9CYZ8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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