Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rrs1Q9CYH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rrs1Q9CYH6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms