Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2fQ9CY34 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms