Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx7Q9CY18 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms