Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed5Q9CXE7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms