Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Prdm5Q9CXE0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prdm5Q9CXE0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prdm5Q9CXE0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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