Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnih4Q9CX13 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnih4Q9CX13 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms