Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms