Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn1Q9CWM4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn1Q9CWM4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pfdn1Q9CWM4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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